Јадрото на Министерството за финансии е составено од следните сектори, преку кои се покриваат сите области од доменот на работа.
Јавни приходи и даночна и царинска политика
Управување со јавен долг
Управување со јавни инестиции
Трезор
Финансиска инспекција во јавниот сектор и координација на борба против измама на ЕУ средствата
Централна хармонизација на системот на внатрешна финансиска контрола во јавниот сектор
Буџети и фондови
Управување со средства
Централно финансирање и склучување на договори ЦФЦД
Финансиски систем
Внатрешна ревизија
Економска политика и развој
Управување со средствата од инструментот за претпристапна помош- ИПА
Кабинет
Академија за јавни финансии
ИТ технологија и дигитализација
Правни работи
Општи работи
Финансиски прашања
Меѓународни финансиски односи
Сектор за управување со човечки ресурси
